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Western Blot完全指南:手把手教你避開(kāi)科研深坑!
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01.Western blot 的起源
1975年,Edwin Southern發(fā)明了DNA雜交檢測(cè)技術(shù),命名為Southern blot。
1977年,James Alwine、David Kemp和George Stark發(fā)明了RNA雜交檢測(cè)技術(shù),命名為Northern blot。
1979年,位于美國(guó)斯坦福大學(xué)的George Stark發(fā)明了將蛋白從電泳凝膠上轉(zhuǎn)移到活化纖維素上的技術(shù),隨后Harry ToWestern blotin發(fā)展出更快速、簡(jiǎn)單的“三明治”結(jié)構(gòu)電轉(zhuǎn)技術(shù)。
1981年Neal Burnette為了方便推廣這一技術(shù)正式將這一技術(shù)命名為“Western blot”
02.Western blot 的用途
①確定目的蛋白的表達(dá)情況
這是Western blot最常規(guī)的應(yīng)用,如檢測(cè)患者的標(biāo)本與正常人的標(biāo)本、實(shí)驗(yàn)條件處理后細(xì)胞與未處理的對(duì)照細(xì)胞之間目的蛋白的表達(dá)變化情況,通過(guò)灰度分析可以確定目的蛋白表達(dá)水平是升高還是降低。
②研究蛋白間的相互作用
這是與免疫共沉淀(Co-immunoprecipitation,Co-IP)技術(shù)相結(jié)合的一種檢測(cè)蛋白質(zhì)之間相互作用的常用方法。通過(guò)CO-IP技術(shù)將相互作用的蛋白質(zhì)復(fù)合體分離出來(lái)后進(jìn)行凝膠電泳,然后利用相互作用的蛋白質(zhì)的特異性抗體進(jìn)行檢測(cè)。適用于對(duì)已知的蛋白質(zhì)的相互作用進(jìn)行檢測(cè),不適用于檢測(cè)一個(gè)蛋白質(zhì)未知的相互作用蛋白;也可以用于蛋白質(zhì)-DNA、蛋白質(zhì)-RNA相互作用的后續(xù)分析。
③確定目的蛋白的細(xì)胞定位
通過(guò)分別提取細(xì)胞不同部位的蛋白質(zhì),如膜蛋白、胞漿蛋白核蛋白或線粒體蛋白等,將分離出來(lái)的不同部位的蛋白質(zhì)進(jìn)行Western blot檢測(cè)可以分別檢測(cè)目的蛋白在不同部位的表達(dá)情況。
03.Western blot 的原理
01.通過(guò)凝膠電泳按照分子量大小分離蛋白。
02.將凝膠緊貼膜放置,同時(shí)施加電流引導(dǎo)蛋白從凝膠遷移到膜上。進(jìn)行免疫染色時(shí),由于電泳凝膠不利于抗體與其中的蛋白結(jié)合,所以需要進(jìn)行蛋白轉(zhuǎn)膜。
03.過(guò)靶向目標(biāo)蛋白的特異性抗體進(jìn)一步孵育膜,再通過(guò)二抗和檢測(cè)試劑顯示檢測(cè)信號(hào)。
04.Western blot 抗體選擇
避坑指南:抗體選擇的黃金法則
Western blot 的靈敏度和特異性取決于抗體的質(zhì)量和使用抗體的實(shí)驗(yàn)條件。在使用含有血清和內(nèi)源性免疫球蛋白的組織裂解液或組織培養(yǎng)上清液時(shí),所選一抗的種屬應(yīng)有別于樣本種屬。例如,如果您研究的是小鼠蛋白,應(yīng)選擇在非小鼠的種屬中培養(yǎng)的一抗(例如在兔中培養(yǎng)的一抗)。這是為了避免免疫球蛋白二抗與樣本中的內(nèi)源性免疫球蛋白發(fā)生交叉反應(yīng)。使用不含內(nèi)源性免疫球蛋白的樣本時(shí),一抗宿主種屬的選擇相對(duì)沒(méi)那么嚴(yán)格。
為了使蛋白顯色,需要選擇一種可與一抗結(jié)合的(不同于一抗宿主種屬的)二抗。使用酶聯(lián)二抗,例如辣根過(guò)氧化物酶 (HRP) 偶聯(lián)抗體或堿性磷酸酶 (AP) 偶聯(lián)抗體,或者經(jīng)Western blot 優(yōu)化的熒光偶聯(lián)抗體,可以提高靈敏度。記得確認(rèn)偶聯(lián)抗體的光發(fā)射波長(zhǎng)是否與您的讀數(shù)裝置/掃描儀兼容。
與單獨(dú)的一抗相比,偶聯(lián)二抗的靈敏度更高,因?yàn)槎箍梢栽诙鄠€(gè)位點(diǎn)與一抗結(jié)合,從而增強(qiáng)信號(hào)。信號(hào)增強(qiáng)有利于檢測(cè)復(fù)雜蛋白混合物中的目標(biāo)蛋白,所以二抗非常適合用于 Western blot。
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